OIXCLOUD / VISUALIZATION
图形要保留数据的采样边界
了解corn plot、二维切片与三维胚胎模型如何展示空间基因表达,以及颜色尺度与平滑的影响。
corn plot适合快速比较
它把连续切片和方向排列成二维结构,既保留空间关系,又方便并排观察多个基因。图形必须附带统一色标和原始采样点。
三维模型强调连续结构
模型有助于理解跨切片关系,但视觉上的平滑表面不代表每个位置都被直接测量。切片间隔与重建方法应被明确说明。
避免让颜色替代证据
归一化、范围拉伸与缺失值会改变图像。关键判断应回到表达矩阵、重复样本和独立验证。