OIXCLOUD JOURNAL
空间数据研究文章
围绕真实研究问题组织方法、证据和适用边界,文章按发布日期由新到旧排列。
空间质量指标为什么也要画回组织坐标
质量指标不是脱离位置的一列数字。把UMI、检测基因、线粒体比例、阈值命中与配准结果画回组织,才能看见边缘、批次、图像和真实组织梯度。
空间转录组如何保留组织中的位置信息
从组织切片、空间坐标和表达矩阵出发,理解空间转录组为何不能被简单看成带图片的RNA测序。
Geo-seq从组织切片到表达图谱的完整流程
按实验顺序梳理冷冻切片、激光显微切割、低细胞数测序、空间重建和结果复核。
GSE65924样本编号与空间位置怎么阅读
理解胚胎编号、切片顺序与A、P、L、R位置标记,避免把样本名称误当普通技术编号。
corn plot为什么适合展示胚胎基因表达
从结构对应、颜色尺度和切片连续性理解corn plot的优势与限制。
zipcode mapping如何推测细胞的空间位置
解释标志基因、相关性、参考图谱和置信边界如何共同构成细胞位置映射。
单细胞RNA测序与空间转录组有什么区别
比较两类技术在细胞分辨率、组织位置、样本处理与研究问题上的不同。
OixCloud跨设备整理研究资料的方法
把原始数据、分析脚本、图表和研究说明按可追溯关系组织,而不是只同步一个文件夹。